Il toponimo "Boara" può essere inteso in due modi: il primo lo fa risalire a "boarìa", cioè alla stabulazione dei bovini nel territorio.
E' questa l'interpretazione più semplice che tuttavia sembra contrastare con il fatto che la stabulazione nella zona risale a non oltre il XVII-XVIII secolo.
L'altra ipotesi riporta invece Boara al longobardo "bouga", in origine anello, termine che veniva utilizzato anche per indicare il vortice d'acqua.
Questa interpretazione potrebbe essere sostenuta facendo riferimento alla conformazione del territorio: il fiume, infatti, faceva qui un'ampia curva che venne raddrizzata nel corso delle opere idrauliche realizzate nel XVIII secolo dai veneziani.